La fecundación es interna. Son ovíparos; es decir, ponen huevos, en nidos que construyen con palos y ramas. Mas ésta es solo la parte superior. Los huevos en cuestión están enterrados. A veces, las tortugas aprovechan los nidos de los cocodrilos, que protegen su nido e incuban sus huevos.
Poseen además un corazón formado por cuatro cavidades (dos aurículas y dos ventrículos). Son poiquilotermos y ectotermos; es decir, que su temperatura corporal varía con la ambiental.
Respiran mediante los pulmones. Son los animales de respiración pulmonar que más tiempo pueden aguantar bajo el agua; sus pulmones son tan grandes que puede llegar a estar seis horas bajo el agua si está en continuo movimiento; si se mantiene quieto, es decir, consumiendo la cantidad mínima de oxígeno por minuto, es capaz de permanecer dos días seguidos bajo el agua. El abdomen y el tórax están separados por un diafragma muscular que también es usado en la respiración.
Los cocodrilos son reptiles de gran tamaño, de cabeza ancha, aplanada y de forma triangular, con fuertes mandíbulas, que poseen dientes muy agudos que se abren con los maxilares; las aberturas de los oídos se encuentran a ambos lados de la cabeza y los orificios nasales y los ojos son prominencias que sobresalen de la misma.
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